Внешняя угроза могуществу Габсбургов на время отпала, но зато обострились 
отношения в самой Германии. С каждым годом вражда между протестантами и 
католиками все возрастала. Император до последней возможности старался 
примирить 
их между собой. В декабре 1545 г. ему удалось пересилить упрямство папы и 
собрать церковный собор в Триденте, но время оказалось упущенным. Протестанты, 
набравшие за последние годы в Германии огромную силу (из четырех светских 
курфюрстов трое были протестантами), уже не желали подчиняться его решениям. 
Карл понял, что пришло время навязать свое мнение силой оружия.

В 1546 г. . началась так называемая Шмалькальденская война. Момент был выбран 
Карлом очень удачно, так как среди протестантских князей царил раскол. Самый 
могущественный из них, герцог Саксонский Мориц, перешел на сторону императора и 

сражался под его знаменами. Сам Карл объявил, что целью его похода в Германию 
будет не стеснение веры, а единственно приведение в покорность некоторых князей,
 
которые под прикрытием веры не уважают более ни суда, ни законов, ни 
императорского сана. Часть протестантских князей сохранила нейтралитет, и это 
было очень выгодно для Карла. Он объявил г лавных членов Шмалькальденского 
союза 
мятежниками и двинул в Германию большую армию, составленную из испанских и 
итальянских наемников. Первая встреча противников произошла осенью подле 
Ингольштад-та на Дунае. После ожесточенной пушечной пальбы протестанты, не 
доводя дела до решительного сражения, отступили. После этого Ульм, Аугсбург, 
Франкфурт и Страсбург изъявили императору свою покорность и уплатили большие 
штрафы. Герцог Вюртемберг-ский и пфальцграф Рейнский согласились на условия, 
предложенные победителями. В начале 1547 г. вся южная и западная Германия уже 
подчинялись Карлу. Он в это время так страдал от подагры, что лежал на носилках,
 
будто разбитый параличом, и г оворил слабым г олосом, но был очень рад 
достигнутым успехам и решил немедленно двинуться в северную Германию. Курфюрст 
Саксонский ждал врагов у Мюльберга. Императорская армия перешла через Эльбу и 
24 
апреля внезапно напала на врага. Курфюрст, имевший вчетверо меньше сил, стал 
поспешно отступать. Испанская и неаполитанская конница рассеяла немецкую и 
нанесла врагам сильный урон. Сам курфюрст Иоанн Фридрих оказался в плену. Карл 
обошелся с ним очень надменно и далеко не милостиво. Сначала он приговорил 
курфюрста к смерти, но потом, смягчившись, согласился сохранить ему жизнь, но 
отнял курфюршество вместе со всеми владениями и передал их Морицу. Города 
Северной Германии изъявили свою покорность. В июне Карлу сдался другой вождь 
протестантов - пфальцграф Гессенский. Разъезжая по протестантским владениям, 
император приказывал повсюду срывать замки, выдавать ему артиллерию и 
выплачивать штрафы. Пишут, что герцог Альба и другие фанатики-католики 
предлагали выбросить из могилы тело Лютера и сжечь его. Но Карл отвечал: 
"Оставьте его в покое, он имеет другого Судью. Я воюю с живыми, а не с 
мертвыми".

В сентябре Карл созвал рейхстаг в Аугсбурге. Побежденные протестантские князья 
вынуждены были уступить нажиму католической партии. Они согласились подчиниться 

решениям Вселенского собора в Триесте, от чего прежде отказывались. Казалось, 
что дело примирения сдвинулось с мертвой точки, но как раз в это время 
разгорелась ссора между императором и папой Павлом III, который самовольно 
перенес собор в Болонью, где мог легко воздействовать на его решения. Поскольку 

протестанты наотрез отказались подчиниться решениям такого собора, процесс 
примирения вновь застопорился. Впрочем, Карл видел, что папа и не желает мира, 
а 
хочет расправиться с протестантами как с еретиками. Раздосадованный 
неуступчивостью Рима, Карл сказал папскому нунцию: "Папа упрямый старик и 
только 
г убит церковь. Я сам созову собор, который удовлетворит всех и поправит то, 
что 
еще можно поправить". Он поручил рейхстагу разработать временные правила 
примирения, которые будут действовать до решения религиозного спора Вселенским 
собором. Из всего, что он делал в это время, видно, что Карл искренне хотел 
религиозного мира. Он не стал требовать замены протестантского богослужения 
католическим и возвращения конфискованных церковных имений. Однако от 
протестантов потребовали подчинения папской власти, восстановления епископств, 
признания за церковью исключительного права на толкование Священного писания, 
почитания икон, восстановления постов и других уступок, на которые протестанты 
могли согласиться только по принуждению. В мае 1548 г. аугсбургский инерим был 
принят рейхстагом. Одновременно Карл обещал провести необходимые преобразования 

в католической церкви.

Следующие пять лет стали временем наивысшего могущества Карла: Франция была 
побеждена, в Испании и Италии он имел почти неограниченную власть, в Германии